饮用水源水体中的有机污染物成分复杂，种类繁多，而且分布广，具有多个污染源。当前，对其污染物的监测方法主要有：气相色谱法，液相色谱法，离子色谱法，分光光度法以及荧光光谱法。其中前3种运用较多。
　　1、气相色谱-质谱联用技术
　　运用气相色谱进行监测的时候，通常与质谱联用，统称气相色谱-质谱技术。气相色谱的原理是利用不同组分的物质在固-液2相中不同的吸附系数或者分配比例，色谱柱有一个前后次序，从而物质分离。其后的质谱可以对检测的物质知道分子量，并进行逐一的验证和鉴定。这种方法可以对多组分进行同时分析，效率高，选择性好，具备灵敏性。对水体中的痕量农药、烃类物质和联苯多氯类等有机物有良好的检测效果，并且该法在水体污染物监控中使用较广。用气相色谱-质谱法对饮用水处理过程中的二甲基亚硝胺进行了分析和检测，探讨了该物质在氧化时候的形成机理。水体中的氯均三嗪等物质的检测和解决一直是课题攻关的难题。气相色谱-质谱对活性炭处理之后的水体中的检测精度可以达到0.01&mu；g/L，从而解决了这个问题。
　　2、液相色谱-质谱技术
　　该项技术也叫液质联用，以液相色谱做分离系统，利用经过色谱柱的流动相各组分在固定相上的吸附、亲和能力不同从而分开，然后经过质谱分析知道物质的分子量、自身结构和种类。和气相色谱一样，液相色谱-质谱技术在有机污染物的检测方面也是应用广。赵余利等对饮用水中含有的氯代苯系物和溴代苯系物通过液质联用进行检测。结果显示该法有良好的灵敏度，对饮用水源地水消毒过程中产生的氯化副产物提供了借鉴意义与有用的信息。对于地表水中残留的农药或者其它药物成分的残余，可以先通过固相萃取富集相应的污染物，然后通过液相色谱-质谱进行定量分析，对痕量物质的质量浓度在0.01～0.02&mu；g/L范围内就可以检测。
　　3、离子色谱-质谱技术
　　离子色谱是液相色谱的一种方法，可以对阴离子和阳离子进行分析，所以适用于水体中的金属离子或者高氯酸离子等有机物的检测。离子色谱的分离方式主要有3种：离子对色谱、离子排斥色谱和离子交换色谱。它们的分离机理又各不相同。离子对主要是基于吸附和形成离子对；其余2种分别是基于离子排斥和交换。离子色谱的检测器可以分为电化学和光学检测器。与质谱分析联用之后，可以增加定性和定量分析的准确性以及灵敏度。该法对饮用水中含有的生物胺、有机酸和有机离子等痕量物质的检测具有好的效果。运用离子色谱和电喷雾离子化质谱联用测定饮用水中的高氯酸盐浓度，检测区间可以达到4ng/L。色谱和质谱的联用实现了2者互补，对水体中的多种组分构成的混合物是一个有用的检测工具，并且可以分离，定性和定量分析混为一体。但是饮用水中还含有一些热稳定性不够的有机物质，色谱检测已经不能发挥作用，一些新兴的方法方兴未艾。
　　4、其它新型检测方法
　　一些水体中的病毒和细菌很难通过色谱分析的方法定性检测。水中的蓝藻会产生微囊藻毒素，采用液相和紫外光谱结合的方法在测定含量的同时也进行了该物质的氧化特性研究。有机砷化合物也是一种难检测并且易清理的一种物质，采用新式的诱导耦合等离子体质谱分析和X光衍射，测试了它在水体中的质量浓度含量。应该说，每种检测方法都有自身的优缺点。不同物质其种类和性质不一样，检测手段不尽相同，而且对于不同的浓度，色谱和质谱检测的条件要进行调整。面对日益复杂的水环境，多种方法结合可以达到检测的目的，但是随之而来的投资成本就相应地变高。对于新兴的方法，相对而言，可以检测的物质比较单一，很难有很广的推广和运用。对于饮用水水源中的有害物质的检测方法仍然处于不断的研究和探讨阶段。
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